出雲国風土記に「美久我社」、延喜式神名帳に「彌久賀神社」と記載されている古社です。

主祭神は、神代の昔、天地いまだ漂う時初めて宇宙を治められた神代最高位の大神、天之御中主大神（あめのみなかぬしのおおかみ）さまで、天照大神さまの御尊父さまです。何時頃からこの地に奉られた定かではありません。

中世から近世にかけて「若一王子権現御社（にゃくいちおうじごんげんおやしろ）」と称しました。その若一王子権現御社は全国に数社ありますが、それは熊野信仰で修験道での崇敬する加持祈祷の神社であって、「天照大御神」を祀っています。当社は、その天皇大御神を祀った社ではありませんが、大御神の祖父神を祀っていることから、若一王子権現御社となったものと思われます。

例祭時、特殊神事として神幸神事（みゆきしんじ）を行います。祭典中に神輿の小宮へ御分霊を遷し、当社本願である北屋を御旅所として御幸祭を斎行します。

当社の地名区域は、神門水海（かんどのみずうみ）のほとりにあります。西は海岸に面し、薗の長浜の南から石見の国境中島崎までの、いわゆる国引神話の綱に当たる「美久我林」という砂丘地です。その「美久我林」を土地の神「美久我神」とし守護していました。
美久我は「海洋に沿うた陸地」という意味があります。