現地ならではの魅力を体感していただくため、荒神谷遺跡に隣接したサイトミュージアムとして建設されました（平成17年10月6日開館）
博物館では展示のほか講演会やイベント開催などを通じ、荒神谷遺跡、そして遺跡を中心とする出雲の原郷の歴史・文化を未来へ伝えるべく情報発信を行っています。

【荒神谷展示室】
・銅剣・銅鐸・銅矛レプリカ展示
（国宝荒神谷青銅器は期間での展示となります）

・大型映像「発掘ドキュメント」「出雲の原郷」を上映

・パネルなどを使って荒神谷の謎に迫る、
「銅剣のなぞ」「銅鐸・銅矛のなぞ」のコーナー
　

・弥生時代のくらしを再現したミニジオラマ展示

そのほか、企画展示室では、出雲市内の考古学資料をはじめとする古代出雲、山陰の歴史・文化をテーマとした貴重な遺物を展示しています。

史跡公園で採れた古代米やハスの種、ハスの葉茶、青銅器をモチーフにしたオリジナルグッズ、お土産に最適な甘納豆やおせんべいといった魅力的な商品が満載のミュージアムショップ「出雲の原郷店」。
書籍は特に充実しており、銅剣/銅鐸・銅矛発掘調査外報、荒神谷公式ガイドブック、図録、古代ハス本といった当館ショップでしか購入できない書籍や、出雲風土記、古事記、日本書紀といった古代出雲関連書籍、写真集なども含めるとその品揃えはなんと随時100冊以上！古代史ファンの方にもきっとご満足いただけること間違いなしです。

・銅鐸花器　サイズ小～大
・銅鐸1/2レプリカ
・銅剣研磨体験(金)
・銅剣ペーパーナイフ(緑)
・銅剣せんべい
・ハス葉皿　サイズ小～大
・古代米　[黒米][赤米]
・ハスの葉茶
・ミライへのタネ(お守り)
・弥生フリーカップ
・缶バッジ　　　　など